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让DNA检测像谷歌搜网页一样简单

日期: 2014-09-28
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腾讯数码  2014年08月24日
 [摘要]六年前人类基因组排序费用高达1000万美元,而现在这项费用只需要1200美元。
 
腾讯数码讯(编译:多多)曾经几何,人类基因组数据的检测非常昂贵并且复杂。通常需要花费数十万美元来进行基因组代码的检测,而花费如此巨大的费用得到的数据实际上仅有一部分有效数据。
现在,这个基因代码检测过程将会变得简单并且费用大大降低。创业公司OneCodex希望能够帮助研究人员、临床医生等相关人员搜索这些数据。OneCodex公司的医疗人员已经对超过10万个基因组进行排序,并且生成了PB级数据。
同时,OneCodex公司还充当了索引参照平台的作用。目前其仍处于开放测试阶段,用户能够对数据库中的数万种细菌、病毒以及真菌数据进行搜索,以每秒钟过滤数百万个DNA碱基对的速度,帮助用户在短时间内找到自己想要的数据。
One Codex的创始人Nick Greenfield表示希望能够将这项技术推广到临床传染病领域。Greenfield介绍道:“就拿治疗肺结核来说,医生不再需要传统的检测方法来确定病情。只需要提取相关样本并且对其进行排序,从而将这种样本转化成数据,随后在所有病原体的数据库中搜索相关数据。搜索结果可以显示病人是否患有肺结核、肺结核患病的类型以及这种结核病对于抗生素是否具有抗药性等等治疗相关的数据。”
目前,One Codex公司的数据库中有超过3万组细菌、真菌以及病毒数据,并且这一数据还在不断增长。六年前,人类基因组排序的费用高达1000万美元,而现在这项费用大概只需要1200美元。虽然这一搜索平台并不像Google搜索平台那样针对个人并且使用率极高,但这一平台的出现不仅节约检测时间而且节约了大笔费用。用一句套话说就是,利国利民。

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