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“互联网+”基因——基因云,首个分钟级别的在线分析系统

日期: 2015-05-06
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 摘自:生物谷

    随着二代测序技术的发展与基因诊断的不断推广,人类的基因数据将成指数性的增长,而这些基因密码将携带者大量的人类已知的信息和未知的密码,在欧美、日本等发达国家,基因已经是他们抢夺的重要战略目标,在中国大量的生物样本和基因信息的管理、储存、分析以及分类,尚没有形成体系。对于临床科研学者和普通老百姓来说,越来越需要一个能够承载复杂的基因数据、在线运算和分享的平台,为疾病的研究以及药物的研发提供大数据的支持。

    2015年3月上海其明信息技术有限公司首个"互联网+基因"的基因数据在线分析系统GCBI投入运营,目前该平台已经对外开放注册。

“互联网+”基因

    李克强总理在两会工作报告中提到"互联网+",并首次提出"把一批新兴产业培育成主导产业",大力发展生物制药、互联网等行业。事实上互联网已经与交通运输、医疗健康、教育等行业相加碰出火花,而这样的案例比比皆是。

    从事高通量生物检测与生物信息数据分析的上海其明信息技术有限公司发现,互联网与基因"相加"能够为传统的生命科学领域与生物医药行业带来颠覆性的变化。以往面临几个问题,大量的基因数据没有得到有效利用,大量的生物样本数据没有系统的保存,对于科研工作者如果研究某种疾病或者药物,需要各处翻阅大量文献比对大量基因数据,而且研究信息不够集中散落在各个地方,甚至还需要学会很多种分析工具,特别是对本就工作特别忙的临床科研医生来说这就是非常困难的事。对于过去的其明公司就算拥有着10年的行业经验和3000多科研伙伴来说,这些都放在面前也未必做到从容不迫。

    随着互联网与云技术的发展,以及关键技术的突破,其明公司感觉到时机越发成熟,利用10年的行业经验和积累,将文献各种资料、基因信息、样本信息、数据算法、以及生物信息处理等技术融合,建立一个"基因知识库"其中涉及生物学、医学、信息学、计算机学、数学、图像学等多个学科领域,这一切注定不简单,包含了120多万份全基因样本,9万份肿瘤样本,26万多份期刊,7000多万份文献,17多万份基因信息等。与互联网的碰撞让这些信息能够系统的展现在使用者面前,每一个知识与信息的环环相扣构造一个完整的知识链条,任何一个人通过互联网都能查看到这些基因信息。

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